Les cartes mères Naomi se différencient par un point précis: leur version du BIOS !
Le BIOS (pour « Basic Input Output System ») est un ensemble de fonctions servant à faire des opérations basiques, contenu dans une petite puce (une EPROM de type 27C160) sur la carte mère. En fonction de la révision du bios présent sur votre carte mère Naomi, certains jeux fonctionneront ou ne fonctionneront pas, ou seront ou non censurés !
Sur chaque BIOS est noté « EPR- + une lettre + une série de cinq chiffres ».
Le bios, encadré en rouge sur l’image
Les chiffres définissent la région:
21576 = Japon
21577 = USA
21578 = « Export » (Europe)
21579 = Corée du Sud
21580 = Australie
En fonction de la région du BIOS, certains jeux fonctionneront ou ne fonctionneront pas ! C’est une forme de zonage de la part de Sega.
A noter aussi que c’est le BIOS qui détermine la langue dans le jeu. Le jeu sera (généralement) en japonais avec un bios jap, et en anglais avec un bios US (si le jeu est compatible avec ce bios).
Ici un bios jap
Les lettres définissent la compatiblité de la carte-mère avec le GD-ROM et la possibilité de linker plusieurs carte-mère.
Lettre D: Le GD-Rom et le link de carte-mère ne sont pas supportés
Lettre E: Le GD-Rom est supporté, mais pas le link
Lettres F et G: Le GD-Rom et le link est supportés.
Néanmois, pas de crainte si votre carte mère a un vieux bios australien avec lettre D; le BIOS s’enlève et se change très facilement. Soit vous avez un programmateur d’EPROM et vous programmez vous-même une EPROM que vous mettez à la place de l’ancienne. Soit vous en commandez une avec la révision de votre choix moyennant une vingtaine d’euros à un site spécialisé.
Le bios le plus universel est EPR-21576G.
A noter qu’il existe un bios « H » sortit à la mi 2007 et qui semble nécessaire pour faire tourner les tous derniers jeux comme Dynamite Dekka EX.
Le tableau de compatibilité des BIOS
Jeux en cartouche
| Nom du jeu | Bios JAP | BIOS US | BIOS EXP | Censuré sur |
| Cannon Spike | x | x | ||
| Capcom vs SNK | x | x | ||
| Capcom Vs SNK 2000 | x | x | x | |
| Cosmic Smash | x | x | x | |
| Crackin DJ | x | x | x | |
| Dead or Alive Millenium | x | x | ||
| Dead or Alive Version 2000 | x | x | x | |
| Dynamite Baseball | x | |||
| Giant Gram 2 | x | |||
| Giant Gram 2000 | x | x | ||
| GigaWing 2 | x | x | ||
| Guilty Gear X | x | x | ||
| Gundam Federation Vs Zion | x | x | ||
| Heavy Metal Geomatrix | x | x | ||
| Marvel Vs Capcom 2 | x | x | x | |
| Outtriger | x | x | x | |
| Power Stone | x | x | US | |
| Power Stone 2 | x | x | US | |
| Sega Tetris | x | x | x | |
| Slash Out | x | x | ||
| Spawn | x | x | ||
| Toukon Retsuden 4 | x | |||
| Virtua Fighter 4 | x | x | ||
| Virtua Fighter 4 Evolution | x | x | ||
| Virtual On | x | x | ||
| Virtua Striker 3 | x | x | ||
| Zero Gunner 2 | x | |||
| Zombie Revenge | x | x | x | US |
| Virtua Tennis | x | x | x | |
| Virtua Tennis 2 | x | x | x |
Jeux sur GD-ROM
| Nom du jeu | Bios JAP | BIOS US | BIOS EXP | Censure |
| Beach Spikers | x | x | ||
| Border Down | x | x | ||
| Capcom Vs SNK 2 | x | x | ||
| Capcom vs SNK Pro | x | |||
| Guilty Gear XX: MC | x | x | x | |
| Guilty Gear XX #Reload | x | |||
| Gundam Fed Vs Zion DX | x | x | ||
| Ikaruga | x | x | ||
| Psyvariar 2 | x | |||
| Shikigami no Shiro 2 | x | x | ||
| Slashout | x | |||
| Spikers Battle | x | x | ||
| Sports Jam | x | x | x | |
| Street Fighter Zero 3 Upper | x | |||
| Trizeal | x | x | ||
| Under Defeat | x | |||
| Virtua Fighter 4 Evolution | x | |||
| Virtua Fighter 4 | x | |||
| Virtua Fighter 4 Final Tuned | x | x | ||
| Virtua Golf | x | x | x | |
| Virtua Striker 3 | x | x | ||
| Virtua Tennis | x | x | x | |
| Virtua Tennis 2 | x | x | x |