Il est l’unique héritier du shogun en titre et ancien élève de Gaoh et de Jubei. Plus intéressé par les femmes et la fête que par la politique, il s’enfuit de chez lui, refusant d’être le prochain dirigeant. Gaoh, persuadé que le Japon ne prospérerait que si Yoshitora gouvernait, déclenche une rébellion dans l‘espoir d’ouvrir les yeux à son élève. Dans le prologue de l’histoire, Haohmaru défie Yoshitora en duel afin de tester sa propre force. Yoshitora refuse mais promet de lui faire face après avoir réglé le problème de Gaoh. Dans sa fin, il interroge les motivations de son ancien maître. Gaoh explique que le shogun est indifférente au peuple et que son règne ne ferait qu’amener famine et désespoir au peuple. Il demande à son élève de devenir shogun. Conscient de la responsabilité de son rôle pour la première fois, Yoshitora accepte finalement la demande de son ancien maître. En tant que shogun, il défie ensuite Haohmaru en duel, demandant à ce dernier de le rejoindre et de l’aider à construire un nouveau pays. Haohmaru répond que s’il perd, il rejoindra Yoshitora. Ils se battent mais le résultat de leur match est incertain.